液相色譜是一類分離與分析技術，其特點是以液體作為流動相，固定相可以有多種形式，如紙、薄板和填充床等。在色譜技術發展的過程中為了區分各種方法，根據固定相的形式產生了各自的命名，如，紙色譜、薄層色譜和柱液相色譜。
(一)保留時間變化
1.柱溫變化：柱恒溫，必要時需配置恒溫箱
2.等度與梯度間未能充分平衡：至少用10倍柱體積的流動相平衡柱
3.緩沖液容量不夠：用》25mmol/L的緩沖液
4.柱污染：每天沖洗柱
5.柱內條件變化：穩定進樣條件,調節流動相
6.柱快達到壽命：采用保護柱
(二)保留時間縮短
1.流速增加：檢查泵,重新設定流速
2.樣品超載：降低樣品量
3.鍵合相流失：流動相pH值保持在3~7.5檢查柱的方向
4.流動相組成變化：防止流動相蒸發或沉淀
5.溫度增加：柱恒溫
(三)保留時間延長
1.流速下降：管路泄漏,更換泵密封圈,排除泵內氣泡
2.硅膠柱上活性點變化：用流動相改性劑,如加三乙胺,或采用堿至鈍化柱
3.鍵合相流失：同前(二)3
4.流動相組成變化：同前(二)4
5.溫度降低：同前(二)5
(四)出現肩峰或分
1.樣品體積過大：用流動相配樣,總的樣品體積小于第一峰的15%
2.樣品溶劑過強：采用較弱的樣品溶劑
3.柱塌陷或形成短路通道：更換色譜柱,采用較弱腐蝕性條件
4.柱內燒結不銹鋼失效：更換燒結不銹鋼,加在線過濾器,過濾樣品
5.進樣器損壞：更換進樣器轉子
(五)鬼峰
1.進樣閥殘余峰：每次用后用強溶劑清洗閥,改進閥和樣品的清洗
2.樣品中未知物：處理樣品
3.柱未平衡：重新平衡柱,用流動相作樣品溶劑(尤其是離子對色譜)
4.(TFA)氧化(肽譜)：每天新配,用抗氧化劑
5.水污染(反相)：通過變化平衡時間檢查水質量，用HPLC級的水
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